为了更好地开展林木种质资源清查保护工作，浙江省制定了清查实施方案，明确各地区和良种基地的技术指导专家。经过有关专家、各地种苗单位和良种基地的共同努力，浙江省林木种质资源清查保护工作取得显著成果。
一、核查全省林木良种基地收集保存的人工种质
2007年以来，浙江省对林木良种基地内所有的种子园、母树林、收集区、采穗圃、繁殖圃和子代林进行了全面清查，共核查良种基地面积14821亩，初步掌握了目前浙江省各林木良种基地和重点科研院所一些收集保存林木种质的数量和相关信息，查清已收集保存含种源、家系、无性系、品种等不同类型的种质资源9181份。
二、开展安吉刘家塘林场、淳安姥山林场等五大育种中心为主的林木种质资源异地保存库建设
确定了浙江省开展五大林木育种中心建设，并明确各自的种质资源保存方向，建设重点分别是安吉刘家塘林场（浙北育种中心）、淳安姥山林场、余杭区长乐林场、龙泉市林科所、金华市东方红林场等。目前已建立了黄山松种质资源库3.3公顷、柳杉种质资源库3.3公顷，迁移保存黄山松种质资源150份、柳杉种质资源110份；新建木荷种质资源收集区兼种子园10公顷，收集保存37个优良种源、150个优良家系；建设了油茶、油桐等种质资源保存区24.3公顷，收集油茶品种109个、油桐品种59个、乌柏品种106个、香榧品种22个、核桃品种31个。
三、完成了自然保护区等重点关键区域的天然原生种质资源调查
天然原生种质资源的调查共设置调查样地300余个，调查原生木本植物1258种，隶属于96科、353属。通过调查发现，省内植物单种属和寡种属比重大，共计1117属，1890种，占全省总属数的89.3%和总种数的55.9%；特有属种和珍稀、濒危植物比较多，具有中国特有属49个，占全国的15%；同时，还发现全省植物物种分布不均，有些地区重要的保护对象比较集中，绝大多数物种都在自然保护区内已经得到有效保护。不仅如此，还新发现包括浙江光叶柿（新种），萝芙木、白花映山红、广东牡荆等17种木本植物浙江地理分布新记录，安徽羽叶报春、有斑百合、鱼黄草等10余种草本植物浙江分布新记录。
四、完成了全省林木种质资源原地保护和异地保存体系初步区划
原地保护工作主要是在原有国家级及省级自然保护区保护基础上，主要以采种基地中的天然林分为主，已建立了3650多亩的原地保护区（点）。异地保存主要依托浙江省近30年林木良种建设成果，充分利用科研院所和历年建成林木良种基地的良好技术与物质基础，以五大育种中心为主。在搞好已收集保存种质资源库的同时，根据育种中心的不同定位，重点加强省内其他良种基地收集保存的种质资源的复制和迁移工作，如衢县林场，舟山市林业科学研究所，庆元林场、营林公司，诸暨市林业科学研究所，安吉龙山林场，天台华顶林场等保存的一些种质资源。经过这些工作的开展，浙江省已经初步形成了原地保护以自然保护区和采种基地为主，异地保存以五大育种中心为重点，其他良种基地保存为补充的全省林木种质资源保护体系。